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    <title>模拟之家-SimuHome - 数据分析/作图</title>
    <link>https://simuhome.cn/forum-7-1.html</link>
    <description>Latest 20 threads of 数据分析/作图</description>
    <copyright>Copyright(C) 模拟之家-SimuHome</copyright>
    <generator>Discuz! Board by Comsenz Inc.</generator>
    <lastBuildDate>Wed, 20 May 2026 22:09:12 +0000</lastBuildDate>
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      <title>模拟之家-SimuHome</title>
      <link>https://simuhome.cn/</link>
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      <title>请问xvg格式的文件用什么软件打开好看些呢？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-153-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问xvg格式的文件用什么软件打开好看些呢？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>zhidun3</author>
      <pubDate>Mon, 11 May 2026 02:24:04 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>关于二面角的疑问</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-152-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问gromacs能探究不同压力条件下小分子的二面角变化情况吗？还是说力场参数就已经确定了二面角的分布，模拟过程中不会再发生变化了？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Lisy</author>
      <pubDate>Thu, 07 May 2026 10:27:39 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>想问下如何分析电解液中 SSIP、CIP、AGG 这类溶剂化结构的占比？需要自己写脚本吗？有</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-151-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[想问下如何分析电解液中 SSIP、CIP、AGG 这类溶剂化结构的占比？需要自己写脚本吗？有没有推荐的教程或工具？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>sunshe</author>
      <pubDate>Thu, 30 Apr 2026 02:17:07 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>在分子模拟过程中，配体 A 较配体 B 可形成更多氢键，这一特征是否也能佐证配......</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-141-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问哈老师在分子模拟过程中，配体 A 较配体 B 可形成更多氢键，这一特征是否也能佐证配体 A 的稳定性优于配体 B？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>lilis</author>
      <pubDate>Mon, 27 Apr 2026 02:14:53 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>我试过网上现成的 Martini 可视化脚本，运行一直报错。导入拓扑文件提示缺少键参数目?</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-136-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我试过网上现成的 Martini 可视化脚本，运行一直报错。导入拓扑文件提示缺少键参数目录，直接导入 tpr 文件又提示路径目录错误，实在搞不懂了，还有其他可视化方法吗？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Xuab</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 02:59:17 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：我构建了一套粗粒化模型，在 VMD 里切换成 VDW 显示模式后，只显示粗粒化珠...</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-135-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我构建了一套粗粒化模型，在 VMD 里切换成 VDW 显示模式后，只显示粗粒化珠子球体，化学键完全不显示，请问该怎么解决？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Xuab</author>
      <pubDate>Mon, 20 Apr 2026 02:57:29 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>请问模拟过程的熵变如何计算</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-126-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问文献上这种模拟过程中的熵变应该怎么计算得到呢]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Lisy</author>
      <pubDate>Tue, 07 Apr 2026 02:47:23 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>Gromacs怎么计算内聚能？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-122-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[Gromacs怎么计算内聚能？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>XXX</author>
      <pubDate>Fri, 03 Apr 2026 05:48:37 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>计算蛋白质 RMSF 曲线出现 “乱连”</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-116-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问用 GROMACS 计算蛋白质的 RMSF（根均方波动）曲线时，得到的结果图出现了明显的 “乱连” 现象，想请教大家这是什么原因造成的？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>lisyw</author>
      <pubDate>Wed, 25 Mar 2026 07:28:29 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>如何分析速度分布</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-109-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问gromacs如何统计分析速度分布曲线呢？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Lisy</author>
      <pubDate>Thu, 19 Mar 2026 08:53:23 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>如何计算体系孔径分布、三维探针分布、连通性</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-97-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[大家好，我是刘建川（网名刘十三），14年GROMACS实战教学；专注分子模拟后处理与孔结构分析实操，帮新手快速搞定Zeo++全流程计算，避开软件安装、格式转换、命令参数的各类坑。今天给大家带来GROMACS体系孔结构分析核心实操：手把手教你用Zeo++计算孔径分布、三维探针分 ...]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>admin</author>
      <pubDate>Mon, 16 Mar 2026 02:51:46 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>如何将 GROMACS 的 xtc 轨迹文件？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-95-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[如何将 GROMACS 的 xtc 轨迹文件与 PDB 结构文件合并，生成可直接用于 PyMOL/VMD 可视化的完整轨迹？？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Solstice</author>
      <pubDate>Fri, 13 Mar 2026 03:31:51 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>Gromacs：计算锂离子 msd（均方位移）时 msd 出现了降低的现象？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-94-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[Gromacs 计算锂离子 msd（均方位移）时 msd 出现了降低的现象，该如何分析 / 解决]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Solstice</author>
      <pubDate>Fri, 13 Mar 2026 03:27:35 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>求助：能否将 gromacs 的 densmap 命令产生的.xpm 文件转化成能用于 origin 画图的数</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-90-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[能否将 gromacs 的 densmap 命令产生的.xpm 文件转化成能用于 origin 画图的数据格式?]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>Vex</author>
      <pubDate>Fri, 13 Mar 2026 03:17:34 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>RMSF 残基波动图怎么画？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-88-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[RMSF 残基波动图怎么画？怎么看哪个区域柔性大？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>hantian</author>
      <pubDate>Tue, 10 Mar 2026 07:52:49 +0000</pubDate>
    </item>
    <item>
      <title>怎么算蛋白回旋半径 Rg（紧凑度）并作图？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-87-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[怎么算蛋白回旋半径 Rg（紧凑度）并作图？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>hantian</author>
      <pubDate>Tue, 10 Mar 2026 07:47:03 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>我的 RMSD 图一直往上飘、不平稳，是模拟崩了吗？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-86-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[我的 RMSD 图一直往上飘、不平稳，是模拟崩了吗？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>hantian</author>
      <pubDate>Tue, 10 Mar 2026 07:46:02 +0000</pubDate>
    </item>
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      <title>GROMACS 算蛋白主链 RMSD 并出图？</title>
      <link>https://simuhome.cn/thread-85-1-1.html</link>
      <description><![CDATA[请问怎么用 GROMACS 算蛋白主链 RMSD 并出图？]]></description>
      <category>数据分析/作图</category>
      <author>hantian</author>
      <pubDate>Tue, 10 Mar 2026 07:36:02 +0000</pubDate>
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