GMXPolymer 是一款基于 GROMACS 的模拟聚合算法工具,主要用于生成非晶态聚合物的交联结构。它通过模拟聚合反应和分子动力学平衡,能高效构建出与实验数据高度一致的聚合物模型。它的核心工作方式是由代码控制一个主聚合循环,在这个循环中反复调用 GROMACS 程序进行能量最小化和分子动力学模拟。每当一个新的化学键形成,它就会自动更新单体的ITP文件,添加新的键、角度和二面角信息,从而动态地构建出聚合物的交联网络。
研究团队已经用不同功能、极性和刚性的玻璃态聚合物验证了该工具的可靠性,模拟得到的结构和热性能与实验数据高度一致。该研究论文数据如下:
GMXPolymer软件已经添加附件,欢迎感兴趣的研究者使用和提出宝贵的建议。
|