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小分子 ITP 导入后报错:Undefined atom type

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发表于 2026-4-15 14:03:13 | 显示全部楼层 |阅读模式
单独生成小分子拓扑文件没问题,把 itpinclude 进 topol.top 后,执行 gmx grompp 直接报错,提示原子类型未定义,检查了好几遍拼写都没问题,不知道哪里出问题。

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发表于 2026-4-17 11:07:20 | 显示全部楼层
需要把小分子的itp里面关于atometype的内容复制到top文件forcefield.itp这一行下面去,如果小分子的itp里面没有,则需要去找生成小分子itp的软件和方法里面的atomtype内容。
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