错误：Group [name] referenced in the .mdp file was not found in the index file

hutu8

我在运行gromacs时候出现下面错误：Group [name] referenced in the .mdp file was not found in the indexfile。请问大家应该如何解决呢？

lauthirteen

.mdp 中的某些参数（如 tc-grps、energygrps）需要指定原子组。如果这个组名不是 GROMACS 默认生成的（如 Protein、Water、System），你就必须提供一个包含该自定义组名的索引文件（.ndx），并通过 -n 选项传递给 grompp。确保你在 grompp 命令中正确使用了 -n index.ndx