GROMACS 运行报错：Undefined atom type 原子类型未定义

reac

环境：GROMACS 2023.4，Linux 系统，小分子配体拓扑文件
各位大佬好，我用 Antechamber 生成了小分子 ITP 拓扑文件，编辑好 TOP 主文件后，运行gmx grompp命令时报错，提示原子类型未定义，检查了好几遍没找到问题，求帮忙指点！

ERROR 1 [file ligand.itp, line 28]:  Undefined atom type 'CH3' in molecule type 'LIG' (residue 1, atom 3)

lauthirteen

是由于你没有把ambertools生成的itp里面的atomtypes复制到forcefield.itp字段下面，或者复制到ffnonboned.itp里面