我用 Packmol 构建了一个模拟盒：盒子中心是硫酸铵团簇，水分子分......

xuanwu2

我用 Packmol 构建了一个模拟盒：盒子中心是硫酸铵团簇，水分子分布在团簇外侧、模拟盒内部。用 VMD 打开结构后，输入pbc box命令，却提示盒子参数设置错误，但我检查了.inp文件，没发现问题。

lauthirteen

packmol生成的pdb盒子是没有盒子边长信息的，需要自己添加。