反式 β 折叠短肽自组装纳米管该如何建模？

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各位做多肽自组装、分子模拟建模的大佬好！我研究的是反式 β 折叠短肽堆叠形成的纳米管状结构，目前已经成功构建出单个短肽的结构，现在卡在后续组装建模的步骤，实在搞不定，特来求助大家：我需要把单个短肽分子，按照参考图的结构先构建成环形矩阵，再纵向堆叠成完整的纳米管。我试过用 Packmol 来建模，但是完全没法实现多肽的环形有序排列和精准堆叠，感觉 Packmol 很难适配这种规整的纳米管组装结构。这种反式 β 折叠多肽的环形矩阵 + 纵向堆叠成纳米管，有什么专用的建模工具、脚本或者实操方法吗？麻烦有相关建模经验的大佬指点迷津，万分感谢！