我在做CoNiP 磷化物基底负载 PTFE 有机分子 + 水溶液体系的分子动力学模拟,能量最小化步骤直接报错,排查很久没找到原因,特此请教!构建体系:无机磷化物(CoNiP)+ 负载的 PTFE 有机分子 + 水溶剂 拓扑处理:通过 top 文件生成了CoNiP-PTFE复合体系的 itp 文件 运行步骤:执行 grompp 生成 tpr、运行能量最小化,直接触发报错
In moleculetype 'CoNiP-PTFE' 272 atoms are not bound by a potential or constraint to any other atom in the same moleculetype.