找回密码
 立即注册
查看: 4|回复: 0

求助:磷化物负载 PTFE 有机分子 + 水溶液体系 能量最小化报错(原子无成键势 / 约束

[复制链接]

1

主题

0

回帖

5

积分

新手上路

积分
5
发表于 1 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在做CoNiP 磷化物基底负载 PTFE 有机分子 + 水溶液体系的分子动力学模拟,能量最小化步骤直接报错,排查很久没找到原因,特此请教!构建体系:无机磷化物(CoNiP)+ 负载的 PTFE 有机分子 + 水溶剂 拓扑处理:通过 top 文件生成了CoNiP-PTFE复合体系的 itp 文件 运行步骤:执行 grompp 生成 tpr、运行能量最小化,直接触发报错
In moleculetype 'CoNiP-PTFE' 272 atoms are not bound by a potential or constraint to any other atom in the same moleculetype.



这个报错是itp 拓扑文件错误导致的吗?问题出在拓扑的哪个部分?

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-6-2 14:53 , Processed in 0.019220 second(s), 20 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表