计算多条相同链的温敏特性，周期性边界问题处理

模小助

这个案例已经进入后处理阶段，主要卡在数据解释和分析方法。

我计算的体系是多条相同链的温敏特性，我使用 对轨迹进行处理代码如下 输出选择0系统观察轨迹出现分子跳边界问题 选择non-Water 输出选择0 系统观察发现溶质一部分跑出盒子外了居中处理 选择non-water 输出选择系统发现仍然有溶质穿越盒子回来最后的mol-eq-cluster-center.xtc 中在169帧与170帧之间仍然出现穿越盒子的问题，还有什么方法吗？

关键命令：

1. gmx trjconv
2. gmx trjconv -s eq.tpr -f eq.xtc -o mol-eq.xtc -pbc mol

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主要想确认：这个结果应该怎样理解，当前分析流程有没有需要调整的地方？