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气体+表面活性剂+水的多组分体系,适合粗粒化还是全原子模型?

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超级版主

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发表于 前天 20:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
把一个建模路线问题整理出来,看看大家会怎么处理。

想问问体系为气相1+气相2+表面活性剂+水,目标是研究这两种气相在该体系中的分散行为

主要想确认:这类体系用什么建模流程更稳妥,前处理阶段需要特别注意什么?

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管理员

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发表于 前天 22:25 | 显示全部楼层
建模阶段建议先把体系拆开验证:每种分子/材料的拓扑单独通过 grompp,确认电荷和几何正常,再组合成完整盒子。这样比把所有东西一次塞进去后再排错效率高很多。

组合后重点检查最小原子距离、盒子/PBC、分子数量和总电荷,再进入 EM→NVT/NPT。
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