错误：With Verlet lists the optimal nstlist is >= 10

hutu8

我在运行gromacs时候出现下面错误：With Verlet lists the optimal nstlist is >= 10, with GPUs >=20。请问大家应该如何解决呢？

lauthirteen

ROMACS 默认使用 Verlet 截断方案，它要求 nstlist（更新邻域列表的频率步数）不能太小，否则会影响性能或精度。根据你的硬件配置，将 .mdp 中的 nstlist 设置为至少 10（CPU），如果使用 GPU 则建议设置为 20 或更大