运行gromacs时候，设置了energygrps参数之后运行效率变慢

hutu8

我在运行gromacs时候，设置了energygrps参数之后运行效率变慢。请问大家应该如何解决呢？

lauthirteen

在成品模拟时候最好删除energygrps参数，这个参数会拖慢运行效率。如果需要计算相互作用能，等运行完毕之后，再在mdp里面添加该参数，然后使用gmx rerun功能从新生成edr文件（此过程非常快）