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RMSF 残基波动图怎么画？

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发表于 2026-3-10 15:52:49 | 显示全部楼层 |阅读模式

RMSF 残基波动图怎么画？怎么看哪个区域柔性大？

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发表于 2026-3-10 16:19:00 | 显示全部楼层

RMSF 看每个残基波动大小，命令：gmx rmsf -s md.tpr -f md.xtc -o rmsf.xvg -res
选择 Backbone。
横坐标：残基号
纵坐标：RMSF
峰值越高 = 该区域柔性越大（ loop、末端通常最高；α- 螺旋、β- 折叠最低）。

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