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模拟报错 今日: 0|主题: 30|排名: 1 

本模块专为 GROMACS 分子动力学模拟 用户提供交流平台,用于分享模拟过程中遇到的问题、交流经验、共同排查与解决各类报错及运行故障。
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伞形采样研究药物穿透皮肤双层脂质模型,关于纳米粒占位影响自由能的疑问 新人帖 sarmjpg 2026-6-11 1109 lauthirteen 2026-6-23 14:29
蛋白质里含有一个砷原子,这个砷原子该用什么力场参数呢? 新人帖 ukuyuc 2026-6-4 098 ukuyuc 2026-6-4 11:01
请教,石墨炔纳米管建模 新人帖 hfbxye 2026-6-1 1124 lauthirteen 2026-6-3 10:45
Gromacs 计算分子转动能(-ekr)输出 XVG 无数据 / 出现 - nan,命令已附求解决 新人帖 xtocjdnz 2026-5-27 0151 xtocjdnz 2026-5-27 12:04
已添加抗衡离子但仍出现体系未中和警报的解决方法 AetherVibe 2026-5-21 1158 lauthirteen 2026-5-26 21:54
请教make_ndx不能创建新的组 新人帖 fqczlvz 2026-5-25 1148 lauthirteen 2026-5-26 21:36
gromacs 输出 vol 0.42 imb F 15%的含义? 新人帖 luozhang 2026-5-25 1134 lauthirteen 2026-5-26 21:35
分子模拟结果文件在VMD中显示异常的问题求助 XiaoMing2026 2026-5-22 1123 lauthirteen 2026-5-25 09:30
分子模拟体系的模型构建与结构优化的相关问题咨询 WangWu_abc 2026-5-22 1110 lauthirteen 2026-5-25 09:29
关于能量最小化出现一堆pdb的相关问题咨询与解决方案求助 ZhangSan_123 2026-5-22 1122 lauthirteen 2026-5-25 09:28
关于冻结原子后还会产生位移的相关问题咨询与解决方案求助 ChenQi_777 2026-5-22 185 lauthirteen 2026-5-25 09:28
关于请问为什么碳纳米管做能量最小化之后总是卷起来?的相关问题咨询与解决方案求助 HuangShi_555 2026-5-22 198 lauthirteen 2026-5-25 09:27
在用 GAFF 力场模拟电解液时,Li⁺和 FSI⁻会发生明显聚集,不能均匀分布在 DME 里, kuaij 2026-4-30 1146 lauthirteen 2026-5-12 09:58
用 CHARMM-GUI 搭建的纯 DPPC 脂质双分子层,在能量最小化阶段出现极大作用力.。。。 新人帖 lucks 2026-4-27 189 lauthirteen 2026-4-29 08:43
运行mdrun提示condition:stat=cudasuccess如何解决 新人帖 accs 2026-4-17 1111 lauthirteen 2026-4-17 10:58
我用 gmx hbond 分析氢键数量时,得到的平均氢键数异常,求助? 新人帖 moou 2026-3-30 1166 lauthirteen 2026-4-1 16:48
老师我在进行npt平衡时出现了这个问题请问是什么原因呢 新人帖 114511 2026-3-30 1128 lauthirteen 2026-3-30 10:23
模拟报错 新人帖 糯米糖葫芦 2026-3-19 1152 lauthirteen 2026-3-20 12:55
用 GROMACS 计算 Zn²⁺ 与小分子氧原子的 RDF,结果如何判断是否合理? 新人帖 luxiaot 2026-3-18 1175 lauthirteen 2026-3-19 10:07
配置GPU加速时失败,提示CUDA架构不支持或版本不匹配 xiaopacai 2026-3-10 1174 lauthirteen 2026-3-10 14:31
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