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本模块 GROMACS 拓扑文件（ITP/TOP）相关交流，用于讨论拓扑生成、参数修改、力场配置、报错排查等问题，帮助大家正确构建与调试模拟体系。

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使用CGenFF生成的GROMACS格式文件如何在topol.top中引用？ New	模小助昨天 14:25	17	admin 昨天 16:55
grompp提示总电荷不为零 New	模小助 3 天前	128	admin 3 天前
用GROMACS周期扰动法做离子液体粘度计算参数设置合理吗 New	模小助 4 天前	130	admin 4 天前
体系动力学一直不稳定，常见原因应该从哪里排查？ New	模小助 6 天前	135	admin 6 天前
进行简单聚合物聚丙烯酰胺的能量极小化时分子跑散，键长很长？ New	模小助 7 天前	137	admin 7 天前
GROMACS跑多聚体的粗粒化模型，单体有解离又快速结合的过程，这正常嘛	模小助 7 天前	138	admin 7 天前
进行位置限制后，NVT和NPT的命令应该如何输入？	模小助 2026-10-5	149	admin 2026-10-5 22:30
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GROMACS模拟锌指结构蛋白质的力场选择与ZN处理是否正确？	模小助 2026-9-30	160	admin 2026-9-30 22:40
带结晶水的GROMACS模拟后结晶水断键	模小助 2026-9-28	164	admin 2026-9-28 22:00
posre.itp怎么使用？	模小助 2026-9-26	166	admin 2026-9-26 22:35
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警告，范德华半径未指定	模小助 2026-9-23	181	admin 2026-9-23 17:50
溶液/溶质分子的力场与主top中Include的力场冲突	模小助 2026-9-21	1103	admin 2026-9-21 21:55
溶剂化遇到原子名称和力场规范不匹配问题怎么解决？	模小助 2026-9-19	1102	admin 2026-9-19 23:15
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AMBER99SB-ILDN 力场的ions.mdp文件怎么写？	模小助 2026-9-15	1115	admin 2026-9-15 22:45
用glycam力场建模后溶剂化怎么给水分子赋予力场？	模小助 2026-9-14	1147	admin 2026-9-14 22:10
低共熔溶剂模拟中遇到的问题	模小助 2026-9-10	1138	admin 2026-9-10 21:35

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