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小分子 ITP 导入后报错：Undefined atom type	renee 2026-4-15	1190	lauthirteen 2026-4-17 11:07
生成GLYCAM力场的纤维素(多糖)及其衍生物TOP文件	lauthirteen 2026-3-19	0520	lauthirteen 2026-4-17 10:50
石墨烯和Ti3C2的ITP参数	sxugm 2026-4-7	3229	lauthirteen 2026-4-16 21:13
模拟一个小分子在PMMA聚合物中的环境,如何确定初始结构以及初始的参数?	fens 2026-4-16	1127	lauthirteen 2026-4-16 20:44
GROMACS 拓扑报错：ITP 文件找不到 / 重复定义分子类型	reac 2026-4-3	1142	lauthirteen 2026-4-3 10:44
GROMACS 运行报错：Undefined atom type 原子类型未定义	reac 2026-4-3	1210	lauthirteen 2026-4-3 10:44
各位老师同学有个 OPLSAA 力场的小问题想请教大家：	licheng 2026-3-25	1237	lauthirteen 2026-3-25 12:37
求助！GROMACS2024.1 做蛋白 - 小分子模拟，top 文件错误导致能量最小化失败，该怎么	pcc 2026-3-25	1200	lauthirteen 2026-3-25 12:03
Ambertool和acpype安装和使用	lauthirteen 2026-3-19	0626	lauthirteen 2026-3-19 19:28
用 CGenFF 处理 Mol2 文件用于 GROMACS 拓扑时失败，该如何处理？	qianwen 2026-3-18	1260	lauthirteen 2026-3-19 10:10
拓扑文件报错?	baomis 2026-3-18	1196	lauthirteen 2026-3-19 10:09
求助：如何使用 Sobtop 创建铁硫蛋白中铁硫簇 [Fe2S2] 的 GROMACS 拓扑文件	Quasar 2026-3-13	1216	lauthirteen 2026-3-13 15:07
请教：GROMACS 中金属原子的 top 文件要怎么写	Vex 2026-3-13	1231	lauthirteen 2026-3-13 15:05
错误：No such moleculetype "XXX"。请问大家应该如何解	双双 2026-3-10	1182	admin 2026-3-10 14:55
错误：Atomtype X not found?	qaz 2026-3-10	1278	admin 2026-3-10 14:54
请问大家应该如何解决呢?Atom index n in position_restraints out of bounds (1-X)。	qaz 2026-3-10	1233	admin 2026-3-10 14:54
我运行 GROMACS 时出现错误？	qaz 2026-3-10	1174	admin 2026-3-10 14:53
[GROMACS] Moleculetype "XXX" is redefined?	qaz 2026-3-10	1133	admin 2026-3-10 14:52
找不到SOL组	qaz 2026-3-10	1142	admin 2026-3-10 14:52
小白求助：Found a second defaults directive file	qaz 2026-3-10	1150	admin 2026-3-10 14:51

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