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石墨烯和Ti3C2的ITP参数	sxugm 2026-4-7	394	lauthirteen 2026-4-16 21:13
模拟一个小分子在PMMA聚合物中的环境,如何确定初始结构以及初始的参数?	fens 2026-4-16	141	lauthirteen 2026-4-16 20:44
GROMACS 拓扑报错：ITP 文件找不到 / 重复定义分子类型	reac 2026-4-3	147	lauthirteen 2026-4-3 10:44
GROMACS 运行报错：Undefined atom type 原子类型未定义	reac 2026-4-3	164	lauthirteen 2026-4-3 10:44
各位老师同学有个 OPLSAA 力场的小问题想请教大家：	licheng 2026-3-25	189	lauthirteen 2026-3-25 12:37
求助！GROMACS2024.1 做蛋白 - 小分子模拟，top 文件错误导致能量最小化失败，该怎么	pcc 2026-3-25	187	lauthirteen 2026-3-25 12:03
Ambertool和acpype安装和使用	lauthirteen 2026-3-19	0296	lauthirteen 2026-3-19 19:28
用 CGenFF 处理 Mol2 文件用于 GROMACS 拓扑时失败，该如何处理？	qianwen 2026-3-18	1113	lauthirteen 2026-3-19 10:10
拓扑文件报错?	baomis 2026-3-18	181	lauthirteen 2026-3-19 10:09
刘建川・GROMACS \| TOP/ITP文件讲解视频	admin 2026-3-16	073	admin 2026-3-16 11:01
求助：如何使用 Sobtop 创建铁硫蛋白中铁硫簇 [Fe2S2] 的 GROMACS 拓扑文件	Quasar 2026-3-13	198	lauthirteen 2026-3-13 15:07
请教：GROMACS 中金属原子的 top 文件要怎么写	Vex 2026-3-13	193	lauthirteen 2026-3-13 15:05
错误：No such moleculetype "XXX"。请问大家应该如何解	双双 2026-3-10	178	admin 2026-3-10 14:55
错误：Atomtype X not found?	qaz 2026-3-10	1132	admin 2026-3-10 14:54
请问大家应该如何解决呢?Atom index n in position_restraints out of bounds (1-X)。	qaz 2026-3-10	177	admin 2026-3-10 14:54
我运行 GROMACS 时出现错误？	qaz 2026-3-10	146	admin 2026-3-10 14:53
[GROMACS] Moleculetype "XXX" is redefined?	qaz 2026-3-10	138	admin 2026-3-10 14:52
找不到SOL组	qaz 2026-3-10	143	admin 2026-3-10 14:52
小白求助：Found a second defaults directive file	qaz 2026-3-10	147	admin 2026-3-10 14:51
gromacs时候出现下面错误：Invalid order for directive 'atomtypes'	双双 2026-3-10	1158	admin 2026-3-10 14:50

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