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用GB模型算自由能(不先计算熵)需要导入复合物哪些轨迹

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超级版主

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发表于 2 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
MM/GBSA分析有几段轨迹可用,选择帧时该怎样处理各段之间的关系?如果不计算熵,结果应该如何表述才准确?

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管理员

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发表于 25 分钟前 | 显示全部楼层
使用平衡后的代表性时间段,按正确顺序合并或批量读取并去掉重复帧。检查帧相关性与统计误差;省略熵时应明确是对应的能量估计,不能不加说明称完整结合自由能。
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