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数据分析/作图 今日: 0|主题: 18|排名: 6 

本模块用于 GROMACS 之外的分子模拟相关软件 交流讨论,包括建模、分析、可视化等工具的使用技巧与问题解答。
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请问xvg格式的文件用什么软件打开好看些呢? 新人帖 zhidun3 2026-5-11 132 lauthirteen 2026-5-12 10:03
如何计算体系孔径分布、三维探针分布、连通性 精华1 admin 2026-3-16 189 lucksanmu 2026-5-11 14:22
关于二面角的疑问 Lisy 2026-5-7 020 Lisy 2026-5-7 18:27
想问下如何分析电解液中 SSIP、CIP、AGG 这类溶剂化结构的占比?需要自己写脚本吗?有 sunshe 2026-4-30 033 sunshe 2026-4-30 10:17
在分子模拟过程中,配体 A 较配体 B 可形成更多氢键,这一特征是否也能佐证配...... 新人帖 lilis 2026-4-27 127 lauthirteen 2026-4-29 08:45
我试过网上现成的 Martini 可视化脚本,运行一直报错。导入拓扑文件提示缺少键参数目? Xuab 2026-4-20 129 lauthirteen 2026-4-22 10:00
求助:我构建了一套粗粒化模型,在 VMD 里切换成 VDW 显示模式后,只显示粗粒化珠... 新人帖 Xuab 2026-4-20 140 lauthirteen 2026-4-22 09:58
请问模拟过程的熵变如何计算 Lisy 2026-4-7 140 lauthirteen 2026-4-7 16:41
Gromacs怎么计算内聚能? 新人帖 XXX 2026-4-3 146 lauthirteen 2026-4-3 14:43
计算蛋白质 RMSF 曲线出现 “乱连” 新人帖 lisyw 2026-3-25 138 lauthirteen 2026-3-27 08:58
如何分析速度分布 Lisy 2026-3-19 153 lauthirteen 2026-3-20 14:08
如何将 GROMACS 的 xtc 轨迹文件? Solstice 2026-3-13 045 Solstice 2026-3-13 11:31
Gromacs:计算锂离子 msd(均方位移)时 msd 出现了降低的现象? 新人帖 Solstice 2026-3-13 053 Solstice 2026-3-13 11:27
求助:能否将 gromacs 的 densmap 命令产生的.xpm 文件转化成能用于 origin 画图的数 新人帖 Vex 2026-3-13 051 Vex 2026-3-13 11:17
RMSF 残基波动图怎么画? hantian 2026-3-10 156 admin 2026-3-10 16:19
GROMACS 算蛋白主链 RMSD 并出图? 新人帖 hantian 2026-3-10 141 admin 2026-3-10 16:18
怎么算蛋白回旋半径 Rg(紧凑度)并作图? hantian 2026-3-10 041 hantian 2026-3-10 15:47
我的 RMSD 图一直往上飘、不平稳,是模拟崩了吗? hantian 2026-3-10 045 hantian 2026-3-10 15:46

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