找回密码
 立即注册
订阅

模拟报错 今日: 0|主题: 18|排名: 1 

本模块专为 GROMACS 分子动力学模拟 用户提供交流平台,用于分享模拟过程中遇到的问题、交流经验、共同排查与解决各类报错及运行故障。
作者 回复/查看 最后发表
在用 GAFF 力场模拟电解液时,Li⁺和 FSI⁻会发生明显聚集,不能均匀分布在 DME 里, kuaij 2026-4-30 130 lauthirteen 2026-5-12 09:58
用 CHARMM-GUI 搭建的纯 DPPC 脂质双分子层,在能量最小化阶段出现极大作用力.。。。 新人帖 lucks 2026-4-27 130 lauthirteen 2026-4-29 08:43
运行mdrun提示condition:stat=cudasuccess如何解决 新人帖 accs 2026-4-17 139 lauthirteen 2026-4-17 10:58
我用 gmx hbond 分析氢键数量时,得到的平均氢键数异常,求助? 新人帖 moou 2026-3-30 185 lauthirteen 2026-4-1 16:48
老师我在进行npt平衡时出现了这个问题请问是什么原因呢 新人帖 114511 2026-3-30 162 lauthirteen 2026-3-30 10:23
模拟报错 新人帖 糯米糖葫芦 2026-3-19 184 lauthirteen 2026-3-20 12:55
用 GROMACS 计算 Zn²⁺ 与小分子氧原子的 RDF,结果如何判断是否合理? 新人帖 luxiaot 2026-3-18 187 lauthirteen 2026-3-19 10:07
配置GPU加速时失败,提示CUDA架构不支持或版本不匹配 xiaopacai 2026-3-10 198 lauthirteen 2026-3-10 14:31
安装后无法运行 gmx 命令。请问大家应该如何解决呢? xiaopacai 2026-3-10 189 lauthirteen 2026-3-10 14:31
运行gromacs时候出现下面错误:There are probably atoms missing earlier in the pdb xiaopacai 2026-3-10 1102 lauthirteen 2026-3-10 14:31
错误:Invalid order for directive 'xxx' xiaopacai 2026-3-10 171 lauthirteen 2026-3-10 14:30
Fatal error: number of coordinates in coordinate file (xx.gro, N) does not match 新人帖 xiaopacai 2026-3-10 177 lauthirteen 2026-3-10 14:30
运行gromacs时候出现下面错误:Atom index n in position_restraints out of bounds 18380446913 2026-3-10 185 lauthirteen 2026-3-10 14:29
错误:Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the 18380446913 2026-3-10 195 lauthirteen 2026-3-10 14:29
运行gromacs时候出现下面错误:Cannot allocate memory 新人帖 18380446913 2026-3-10 158 lauthirteen 2026-3-10 14:29
错误:Fatal error: The total potential energy is nan/inf dongji 2026-3-10 170 lauthirteen 2026-3-10 14:28
错误:Step X: Some atoms have moved too far 或 LINCS WARNING: relative coordinat dongji 2026-3-10 149 lauthirteen 2026-3-10 14:28
错误:Segmentation fault (core dumped) 新人帖 dongji 2026-3-10 170 lauthirteen 2026-3-10 14:27

快速发帖

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-5-21 06:09 , Processed in 0.014328 second(s), 9 queries .

返回顶部 返回版块