ILs+水体系用gmx current计算电流自相关函数的问题

模小助

把一个分析方法上的问题整理出来，看看当前流程是否合适。

体系为ILs+水体系，水模型都用的SPCE。其中ILs选择Gaff力场进行 数据处理，出现多处为0的情况，如图1

关键命令：

1. gmx current

复制代码

主要想确认：这个结果应该怎样理解，当前分析流程有没有需要调整的地方？

admin

这个分析建议先明确“物理问题是什么”，再决定命令和作图方式。尤其要统一轨迹的 PBC/拟合处理、分析时间段和 selection，否则曲线画出来很漂亮也可能没有可比性。

最好同时保留分析命令、选组信息和单位，后续复现或比较不同体系时会省很多时间。