找回密码
 立即注册
查看: 1|回复: 0

在模拟过程中压力和盒子的大小变化浮动很大

[复制链接]

95

主题

0

回帖

358

积分

超级版主

积分
358
发表于 1 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
这里有个 mdp 参数细节,想看看大家通常怎么设。

学好,我在模拟甲烷在溶剂当中的溶解度,在正式的仿真之前,我先进行了能量最小化,然后先用npt模拟了1ns,热浴和压浴分别为V-rescale 和berendsen,然后又跑了2ns的nvt,使用的热浴也是V-rescale,最后进行了正式的仿真,使用的mdp文件如下:

主要想确认:这种参数设置是否合理,哪些选项最值得优先调整?
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-10-10 11:20 , Processed in 0.016876 second(s), 21 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表