用2019.6 版本GROMACS进行拉动C60球和蛋白相互碰撞的仿真报错

模小助

用GROMACS拉动C60与蛋白碰撞时出现报错。牵引组、方向和速度这些设置中，哪些应该先检查？

admin

核对pull组、参考原子、方向、距离和周期边界，再看速率与弹簧常数。碰撞前检查局部重叠和受力峰值；需要完整报错才能区分组定义错误与动力学失稳。