pdb2gmx 给多肽多加了氢

模小助

带非标准封端的多肽经过pdb2gmx后多出了氢原子。想确认是哪里识别错了，残基连接和封端规则应该怎样检查？

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核对封端残基、链标识、端基选择及rtp/hdb中的连接与氢规则。若程序把内部残基识别成端基就可能多加氢；应修正模板和识别，不要只删生成文件中的氢。