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运行gromacs时候出现下面错误:Atom index n in position_restraints out of bounds

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新手上路

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发表于 2026-3-10 14:19:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在运行gromacs时候出现下面错误:Atom index n in position_restraints out of bounds。请问大家应该如何解决呢?

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发表于 2026-3-10 14:29:58 | 显示全部楼层
位置约束文件(posre.itp)中的原子索引,超出了其所属的 [ moleculetype ] 的原子范围,最常见的原因是 #include "posre.itp" 指令放错了位置。确保每个分子的约束文件紧跟在对应的 [ moleculetype ] 定义之后,而不是全部堆在文件末尾。
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