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运行gromacs时候出现下面错误:There are probably atoms missing earlier in the pdb

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新手上路

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发表于 2026-3-10 14:24:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在运行gromacs时候出现下面错误:There are probably atoms missing earlier in the pdb file。请问大家应该如何解决呢?

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版主

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发表于 2026-3-10 14:31:24 | 显示全部楼层
结构文件中间有原子缺失,导致 pdb2gmx 读取时错位,把不连续的两个原子识别为化学键,距离过长 。
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