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模拟报错今日: 0|主题: 18|排名: 1

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	错误：Segmentation fault (core dumped)	dongji 2026-3-10	171	lauthirteen 2026-3-10 14:27
	错误：Step X: Some atoms have moved too far 或 LINCS WARNING: relative coordinat	dongji 2026-3-10	150	lauthirteen 2026-3-10 14:28
	错误：Fatal error: The total potential energy is nan/inf	dongji 2026-3-10	171	lauthirteen 2026-3-10 14:28
	运行gromacs时候出现下面错误：Cannot allocate memory	18380446913 2026-3-10	159	lauthirteen 2026-3-10 14:29
	错误：Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the	18380446913 2026-3-10	195	lauthirteen 2026-3-10 14:29
	运行gromacs时候出现下面错误：Atom index n in position_restraints out of bounds	18380446913 2026-3-10	186	lauthirteen 2026-3-10 14:29
	Fatal error: number of coordinates in coordinate file (xx.gro, N) does not match	xiaopacai 2026-3-10	177	lauthirteen 2026-3-10 14:30
	错误：Invalid order for directive 'xxx'	xiaopacai 2026-3-10	171	lauthirteen 2026-3-10 14:30
	运行gromacs时候出现下面错误：There are probably atoms missing earlier in the pdb	xiaopacai 2026-3-10	1103	lauthirteen 2026-3-10 14:31
	安装后无法运行 gmx 命令。请问大家应该如何解决呢？	xiaopacai 2026-3-10	190	lauthirteen 2026-3-10 14:31
	配置GPU加速时失败，提示CUDA架构不支持或版本不匹配	xiaopacai 2026-3-10	199	lauthirteen 2026-3-10 14:31
	用 GROMACS 计算 Zn²⁺ 与小分子氧原子的 RDF，结果如何判断是否合理？	luxiaot 2026-3-18	187	lauthirteen 2026-3-19 10:07
	模拟报错	糯米糖葫芦 2026-3-19	184	lauthirteen 2026-3-20 12:55
	老师我在进行npt平衡时出现了这个问题请问是什么原因呢	114511 2026-3-30	162	lauthirteen 2026-3-30 10:23
	我用 gmx hbond 分析氢键数量时，得到的平均氢键数异常，求助？	moou 2026-3-30	185	lauthirteen 2026-4-1 16:48
	运行mdrun提示condition:stat=cudasuccess如何解决	accs 2026-4-17	139	lauthirteen 2026-4-17 10:58
	用 CHARMM-GUI 搭建的纯 DPPC 脂质双分子层，在能量最小化阶段出现极大作用力.。。。	lucks 2026-4-27	130	lauthirteen 2026-4-29 08:43
	在用 GAFF 力场模拟电解液时，Li⁺和 FSI⁻会发生明显聚集，不能均匀分布在 DME 里，	kuaij 2026-4-30	130	lauthirteen 2026-5-12 09:58

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