模拟报错今日: 0|主题: 63|排名: 1

本模块专为 GROMACS 分子动力学模拟用户提供交流平台，用于分享模拟过程中遇到的问题、交流经验、共同排查与解决各类报错及运行故障。

新窗全部主题最新热门热帖精华更多 \| 显示置顶		作者	回复/查看	最后发表


GROMACS出现错误，提示在.mdp文件中的Group，在输入文件中匹配不到？	模小助 2026-9-24	1121	admin 2026-9-24 11:45
gmx hbond计算氢键出现边缘网格内存分配缺陷错误：415/905段错误 (核心已转储)？	模小助 2026-9-25	1121	admin 2026-9-25 10:55
以GPU跑MD时，thread不能pin到CPU core上（提示thread pinning disabled）	模小助 2026-9-26	1123	admin 2026-9-26 12:20
进行grompp时警告，不知道是否忽视+mdrun时怎么能跑满20线程？	模小助 2026-9-27	1115	admin 2026-9-27 12:35
gmx报错提示CUDA error #700？	模小助 2026-9-28	1127	admin 2026-9-28 12:15
在使PLUMED对GROMACS的轨迹文件做元动力学时，必须将命令写一起吗	模小助 2026-9-29	1136	admin 2026-9-29 11:15
gmx2019.6使用position restraints时的出现错误？	模小助 2026-9-30	1125	admin 2026-9-30 10:45
通过FEP/TI计算溶解自由能的一些问题	模小助 2026-10-1	1124	admin 2026-10-1 11:35
gmx mdrun -v 输出的各项信息分别代表什么？	模小助 2026-10-2	1105	admin 2026-10-2 12:25
pdb2gmx运行时出现错误？	模小助 2026-10-3	186	admin 2026-10-3 12:45
packmol填充分子，三明治界面模型，GROMACS跑动力学崩溃	模小助 2026-10-4	185	admin 2026-10-4 11:20
GROMACS可以进行含有铜离子的蛋白质的分子动力学模拟吗	模小助 2026-10-5	188	admin 2026-10-5 11:00
gmx hbond做氢键分析得到的氢键数量结果	模小助 2026-10-6	174	admin 2026-10-6 11:45
GROMACS如何计算同组分子内的相互作用能？	模小助 2026-10-7	168	admin 2026-10-7 13:45
错误：Segmentation fault (core dumped)	dongji 2026-3-10	1371	lauthirteen 2026-3-10 14:27
错误：Step X: Some atoms have moved too far 或 LINCS WARNING: relative coordinat	dongji 2026-3-10	1309	lauthirteen 2026-3-10 14:28
错误：Fatal error: The total potential energy is nan/inf	dongji 2026-3-10	1342	lauthirteen 2026-3-10 14:28
运行gromacs时候出现下面错误：Cannot allocate memory	18380446913 2026-3-10	1268	lauthirteen 2026-3-10 14:29
MDAnalysis里计算原子位置时的周期性处理 New	模小助 3 天前	131	admin 3 天前
错误：Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the	18380446913 2026-3-10	1437	lauthirteen 2026-3-10 14:29

12 3 4 / 4 页下一页

返回发新帖

快速发帖

|模拟之家-SimuHome ( 蜀ICP备2023003244号-3 )

GMT+8, 2026-10-15 05:40 , Processed in 0.010425 second(s), 9 queries .

		自动登录	找回密码
密码			立即注册

模拟报错 今日: 0|主题: 63|排名: 1

快速发帖

模拟报错今日: 0|主题: 63|排名: 1