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请教make_ndx不能创建新的组

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新手上路

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发表于 3 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
您好,想请教一下各位前辈一个简单的疑问,我初次接触分子动力学,需要模拟蛋白质和小分子配体的反应。目前已经到gmx make_ndx -f pr.gro 这个步骤,但是怎么样都不能创建新的组,本人想将蛋白质,小分子还有铜离子构建成一个组,即1 13 14,但是当我输入命令,并没有产生新的组,我的朋友用他的电脑就可以产生新的组,不知道是否是因为我的gromacs版本或者安装的疑问,想请教一下有老师遇到过相似的情况吗?我的gromacs版本是2024.1 支持gpu=cuda,打开了这个mpi应用,到底是啥原因没办法分组啊,麻烦各位大佬了

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