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用namd做蛋白质在电场下的分子动力学模拟,跑到一段时间后模拟突然中断

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超级版主

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发表于 2 小时前 | 显示全部楼层 |阅读模式
NAMD电场模拟跑到中途停止输出,但没有看到明确报错。

有什么信息能帮助区分:是作业被终止,还是体系本身失稳了?

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管理员

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发表于 半小时前 | 显示全部楼层
同时检查调度器退出码、墙钟限制、内存和磁盘,再看NAMD最后写出的重启文件。日志停在写文件处不能证明电场导致崩溃;续跑前确认文件完整。
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