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sobtop生成的小分子配体文件导入模拟topol文件的问题

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发表于 昨天 20:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
Sobtop生成的配体ITP接入蛋白topol.top后出现读取错误。怎么逐项检查include的位置和文件内容,定位到底是哪一处出了问题?

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发表于 昨天 22:40 | 显示全部楼层
先区分类型参数段与分子拓扑段,检查include顺序和moleculetype名称。核对坐标原子顺序与[ molecules ];配体参数须与主力场的组合规则及1-4约定兼容。
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