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ITP/TOP拓扑文件今日: 0|主题: 63|排名: 2

本模块 GROMACS 拓扑文件（ITP/TOP）相关交流，用于讨论拓扑生成、参数修改、力场配置、报错排查等问题，帮助大家正确构建与调试模拟体系。

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石墨烯和Ti3C2的ITP参数	sxugm 2026-4-7	3229	lauthirteen 2026-4-16 21:13
警告，范德华半径未指定	模小助 2026-9-23	181	admin 2026-9-23 17:50
如何解决石墨烯在聚合物体系中表现得太柔软的问题呢？	模小助 2026-9-24	181	admin 2026-9-24 23:50
posre.itp怎么使用？	模小助 2026-9-26	166	admin 2026-9-26 22:35
带结晶水的GROMACS模拟后结晶水断键	模小助 2026-9-28	164	admin 2026-9-28 22:00
GROMACS模拟锌指结构蛋白质的力场选择与ZN处理是否正确？	模小助 2026-9-30	160	admin 2026-9-30 22:40
四丁基氢氧化铵（TBAH）分子中TBA+和OH-的力场参数选择的问题？	模小助 2026-10-1	164	admin 2026-10-1 23:10
加入抗衡例子后不能产生gro文件	模小助 2026-10-3	155	admin 2026-10-3 21:55
进行位置限制后，NVT和NPT的命令应该如何输入？	模小助 2026-10-5	149	admin 2026-10-5 22:30
求助：Residue' not found in residue topology database	双双 2026-3-10	1257	admin 2026-3-10 14:49
GROMACS跑多聚体的粗粒化模型，单体有解离又快速结合的过程，这正常嘛	模小助 7 天前	138	admin 7 天前
Atom X in residue YYY not found in rtp entry??	双双 2026-3-10	1146	admin 2026-3-10 14:50
gromacs时候出现下面错误：Invalid order for directive 'atomtypes'	双双 2026-3-10	1334	admin 2026-3-10 14:50
进行简单聚合物聚丙烯酰胺的能量极小化时分子跑散，键长很长？ New	模小助 7 天前	137	admin 7 天前
错误：No such moleculetype "XXX"。请问大家应该如何解	双双 2026-3-10	1182	admin 2026-3-10 14:55
体系动力学一直不稳定，常见原因应该从哪里排查？ New	模小助 6 天前	135	admin 6 天前
用GROMACS周期扰动法做离子液体粘度计算参数设置合理吗 New	模小助 4 天前	130	admin 4 天前
grompp提示总电荷不为零 New	模小助 3 天前	128	admin 3 天前
使用CGenFF生成的GROMACS格式文件如何在topol.top中引用？ New	模小助昨天 14:25	17	admin 昨天 16:55
错误：Atomtype X not found?	qaz 2026-3-10	1278	admin 2026-3-10 14:54

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